Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms