Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhodP97348 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhodP97348 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhodP97348 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhodP97348 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhodP97348 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhodP97348 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms