Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H3f3aP84244 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms