Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cct5P80316 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct5P80316 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms