Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otx2P80206 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms