Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf5P70191 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms