Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crabp1P62965 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms