Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo4P61969 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo4P61969 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo4P61969 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo4P61969 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo4P61969 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo4P61969 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Lmo4P61969 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo4P61969 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lmo4P61969 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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