Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms