Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme3P61290 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms