Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms