Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtnsP57757 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms