Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 635 ms