Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c40P56657 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c40P56657 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms