Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms