Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brcc3P46737 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brcc3P46737 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brcc3P46737 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms