Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms