Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ercc5P35689 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms