Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2aP35436 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2aP35436 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2aP35436 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2aP35436 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2aP35436 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2aP35436 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2aP35436 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms