Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms