Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp12P34960 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms