Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprmP28828 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprmP28828 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprmP28828 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprmP28828 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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