Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxraP28700 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxraP28700 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxraP28700 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxraP28700 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxraP28700 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RxraP28700 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxraP28700 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxraP28700 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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