Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af2P26369 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af2P26369 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af2P26369 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af2P26369 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af2P26369 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af2P26369 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af2P26369 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af2P26369 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af2P26369 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms