Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna1P26231 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms