Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms