Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifrd1P19182 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms