Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irf1P15314 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf1P15314 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms