Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04213 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04213 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P04213 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P04213 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P04213 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P04213 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P04213 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P04213 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P04213 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms