Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01783 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01783 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01783 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01783 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01783 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01783 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01783 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01783 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01783 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms