Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01660 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01660 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01660 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01660 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01660 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01660 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01660 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms