Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arl6O88848 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms