Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spsb2O88838 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms