Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms