Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms