Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt1O88346 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt1O88346 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms