Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtssO70370 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtssO70370 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtssO70370 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtssO70370 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtssO70370 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtssO70370 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtssO70370 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtssO70370 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtssO70370 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CtssO70370 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtssO70370 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtssO70370 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms