Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FiglaO55208 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FiglaO55208 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms