Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngr1O55100 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr1O55100 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms