Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mef2bO55087 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms