Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Copb2O55029 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Copb2O55029 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb2O55029 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb2O55029 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb2O55029 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms