Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bnip3O55003 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnip3O55003 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnip3O55003 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms