Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnajb6O54946 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnajb6O54946 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms