Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms