Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d1bO35324 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms