Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe40O35185 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms