Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2035J3QP87 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2035J3QP87 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2035J3QP87 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2035J3QP87 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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