Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20795J3QP49 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm20795J3QP49 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20795J3QP49 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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