Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim22J3QP37 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim22J3QP37 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms