Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQV1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQV1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQV1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BQV1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BQV1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BQV1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms